Nextflow 生信流程

k-dense-ai/claude-scientific-skills/skills/nextflow

37.1k 0 +37.1k/7d开发工具
平台Claude Code

端到端构建、运行与调试 Nextflow 数据管线与 nf-core 工作流。当用户提到 Nextflow、nf-core、.nf 文件、nextflow.config、DSL2、process/channel/operator、samplesheet,或想跑社区流程(如 nf-core/rnaseq、nf-core/sarek)、用 nf-test 写/测模块或子工作流、配置执行器/容器(Docker、Singularity/Apptainer、Conda、Wave)、把工作流扩到 HPC/SLURM 或云(AWS Batch、Google Batch、Azure、Kubernetes),或调试失败/-resume 运行。即使没说 Nextflow,任何可复现科学/生信工作流也应用本技能;亦用于编写符合 nf-core 规范的流程、模块、配置与 lint。

Claude Code

全部 skill