批量 RNA-seq 流程

端到端批量 RNA-seq 编排器——把原始 FASTQ 读数经 QC 与修剪（FastQC、fastp/Trim Galore）、比对与定量（STAR、Salmon、featureCounts）跑出基因级计数矩阵，再交给差异表达（pydeseq2）、通路/GSEA 富集（pathway-enrichment）与出版级图（scientific-visualization）。用于用户有批量 RNA-seq 读数或定量输出、想要完整可复现的差异表达工作流——如"分析我的 RNA-seq"、"FASTQ 到 DESeq2"、"跑 nf-core/rnaseq"、"STAR/Salmon 定量"、"为 DESeq2 建计数矩阵"，或"从读数到差异基因与富集通路"。在 nf-core/rnaseq（Nextflow）路径与独立 STAR/Salmon 路径间路由，覆盖实验设计、链特异性与 QC 门。单细胞 RNA-seq 用 scanpy。"